普拉克顿有一个像其他人一样的基因组

2021-05-07 04:44:47

根据新的研究,单细胞浮游生物的单细胞浮游生物的基因组是以令人难以置信的奇怪和不寻常的方式组织的。该研究结果奠定了进一步调查这些重要的海洋生物的基础,并且大大扩大了我们的真核生物基因组可以看起来像什么样的图片。来自Kaust,美国和德国的研究人员研究了珊瑚酶-Symbiont Dinoflagellate Symbiodinium microiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatiatic的基因组组织。 S. Microadriaticum已经被测序并组装成称为支架的段,但缺乏染色体水平组件。

该团队使用称为Hi-C的技术来检测Dinoflagelate' S Chromatin的相互作用,DNA和蛋白质的组合,所述DNA和蛋白质组成染色体。通过分析这些相互作用,他们可以弄清楚支架如何连接在一起,给他们一个视图进入基因组的空间和结构组织。

引人注目的发现是,在基因组中倾向于交替的单向块组织。 "真的,真的,与你在其他有机体中看到的东西有什么不同; octavio salazar说,博士学位。曼努埃尔阿兰达的学生' k用k的kaust和研究的引导作者之一。染色体上基因的取向通常是随机的。然而,在这种情况下,基因始终是一种方式,然后是另一个方式,在染色质相互作用数据中清楚地显示块之间的界限。

该组织也反映在基因组的三维中,该团队推断包括棒状染色体,其折叠成基因块收敛的边界的结构域。甚至更具兴趣,这种结构似乎取决于转录活动。当研究人员用化学物质对细胞进行处理时,结构域消失了。

这种不寻常的链接与Dinoflagellate的另一个奇怪的事实一致 - 它们在它们的基因组中很少,并且似乎通过改变基因表达来响应环境变化。它们可以使用基因剂量来控制表达并通过丢失或通过表观遗传结构修饰来调节或获得染色体来适应环境。研究人员计划探索所有这些问题。

另一个开放问题是这种特殊基因组结构的起源。 Dinoflagellates产生很少的组蛋白,其他真核生物使用的蛋白质来构建其DNA,而是仅使用掺入它们的基因组。非凡的基因组结构和遗传调节可能是这些病毒蛋白质如何工作的结果,但仍有待确认。

基因组缺乏从研究其他真核生物构建的期望和教条。 "它表明,自然可以以与我们想象的完全不同的方式工作," Salazar说。 "在生活中可能发生的情况发生了很多可能性。"更多信息:Ankita Nand等,恐龙氨基苯并氨基碘鎓微观植物,自然遗传学(2021)的异常染色体的遗传和空间组织。 DOI:10.1038 / s41588-021-00841-y