研究严重COVID-19的遗传学

2020-12-18 15:15:08

机体对SARS-CoV-2感染的反应范围从无法察觉到死亡,这提出了一个明显的问题:差异何在?如果我们能够确定使COVID-19对某些人如此危险的因素,我们将尽最大努力解决这些因素,并为高风险人群提供额外的保护。但是,除了显而易见的问题(与贫困和种族相关的健康差异似乎也在发挥作用)之外,我们还难以确定造成差异的因素。

最近发表的一项研究着眼于一种潜在的影响:遗传学。在一项针对英国COVID-19患者的大型研究中,研究人员发现了许多与严重病例有关的基因,其中大多数与免疫功能有关。但是结果并未阐明免疫功能与疾病进展的关系。

该工作在英国进行,该国家是重症监护死亡率遗传学项目GenOMICC的国家之一,该项目已经在探索传染病住院治疗的遗传学。对于这项新研究,研究人员与英国的200多个重症监护病房合作,确定了研究参与者。总而言之,他们设法获得了2700多名关键COVID-19患者的遗传数据。他们与英国生物库中具有相似人口统计特征的人相匹配,以提供对照人群。这种设计的一个缺点是,生物库中的某些人可能容易感染严重的COVID-19,但还没有被感染,这会削弱任何遗传信号。

该研究小组进行了两项分析,以寻找与严重COVID-19相关的基因。第一个是标准的全基因组关联分析,其中对整个基因组进行扫描,以查找在那些患有严重疾病的患者中更常见的变体。研究人员将不同种族的人群进行了分析,因为信息量偶尔会有所不同。仅有足够大的人群进行全面分析的一组人是欧洲血统的人,他们将病例数限制为1,676。

使用该组,分析得出了整个基因组中的15个不同位置。为了使研究重新生效,研究人员还换了其他遗传资源中的不同对照组。此外,他们还使用了其他案件来源,包括23andMe,其成员中已经登记了1,100多个案件。这些重新分析消除了15个原始基因组位点中的7个,剩下8个已复制。

该团队所做的第二项分析是研究基因的活性,该基因的活性通过转录为RNA副本来衡量,这是制造蛋白质的关键步骤。研究人员检查了肺和血液中的RNA产生,然后将这些结果与研究另一部分中已确定的遗传因素的位置进行了比较。

总体而言,从该分析中得出的基因分为两组。一种涉及涉及对病毒感染的初始反应的基因,这是所谓的先天免疫系统的一部分。其中之一是免疫信号分子(干扰素)的受体,当细胞检测到病毒存在时会被诱导。干扰素信号传导问题已经与严重的COVID-19病例相关,因此这是这项工作的重要验证。属于此类别的另一个基因是导致激活一种酶的途径的一部分,该酶咀嚼双链RNA,双链RNA是某些病毒的遗传物质,是生产新冠状病毒的关键中间产物。

另一组基因通常属于炎症性免疫途径。一种是具有几种相关作用的酶,包括激活一些免疫信号分子和协助T细胞识别感染的细胞。另一个是参与调节免疫活性的信号传导途径的一部分(JAK / STAT途径)。其他变体改变了关键的免疫信号分子趋化因子受体集合的活性。

在发现免疫系统活性与感染的严重程度有关时,这看起来像是“杜赫”。此刻,结果所提供的信息或多或少比可能看起来要多。实际上,非常有趣的是,除了免疫相关基因之外,没有其他东西出现在这个屏幕上,这表明遗传因素可能不会在感染的进行或最终受损的组织中发挥重要作用。鉴于其他屏幕上出现的某些内容(例如A / B / O血型)并非来自此屏幕,因此这也很有帮助。

但是知道参与了免疫反应并不一定告诉我们它在做什么。严重的健康问题是否来自使该病毒疯狂传播的贫血免疫反应?还是因为免疫系统过度运转而开始损害组织而来?考虑到此处鉴定出的两组基因,可能甚至是两者中的一部分-早期反应较弱,随后在感染中出现过度活跃的炎症。

尽管如此,鉴定值得进一步研究的基因仍是重要的早期步骤。 COVID-19的进展及其症状的不规律收集,其恢复期变化很大。找出可能有助于这项工作的细节,可以帮助我们做出更明智的治疗决策。