荷兰科学家重建冠状病毒在水貂养殖场的传播

2020-11-11 06:47:01

目前还不清楚哪些物种携带SARS-CoV-2冠状病毒进入人类体内。但越来越清楚的是,我们可以将它传播到大量物种,然后这些物种中的一部分能够将它传递给其他物种。如果这些物种能够将病毒传给人类,就会增加新冠肺炎大流行带来的风险。这是因为它为新的感染提供了一条途径,避免了我们试图控制病毒在人与人之间传播的所有手段。而且,在动物体内繁殖的病毒也有可能选择一种突变,使病毒对人类更危险。

虽然我们已经在猫和狗身上发现了这种病毒,但到目前为止,最大的风险被证明是一个意想不到的来源:水貂。早在8月份,很明显,这种病毒正在杀死美国水貂养殖场的大量动物。本月早些时候,发现它已经从水貂传播回人类,导致丹麦决定扑杀整个水貂种群。现在,随着一些人因为这一激烈的行动而紧张不安,我们有了一份报告,提供了在水貂和人类之间传播的病毒的详细追踪,让我们更好地了解其中的风险。

这项工作是在荷兰完成的,荷兰也拥有大量的水貂养殖场。这篇由公共卫生和兽医官员撰写的新论文,本质上相当于一份针对水貂的接触者追踪报告。它结合了诊断学来识别接触过SARS-CoV-2的人和动物,使用全基因组测序来了解这些感染源,并使用访谈(仅限于人类)来帮助确定可能影响病毒传播的任何行动。

总体而言,研究人员能够追踪到16个不同农场的感染情况,尽管至少在一个案例中,两个农场拥有相同的所有者和共同的工人。研究人员还将在这些农场发现的病毒基因组与在荷兰普通人群中发现的1700多个病毒基因组进行了比较。

从调查中可以非常清楚的一件事是:这种病毒在农场工人中很普遍。在大约100名接受测试的人中,68%的人要么目前感染了病毒,要么携带了表明过去感染过的抗体。据了解,许多人要么患上了新冠肺炎,要么报告说在采访期间出现了呼吸道症状。

样本取自活动性感染者,并对整个基因组进行了测序,使研究人员得以重建其进化史。在这些病例中,农场工人都携带了一种病毒,这种病毒与已知在水貂中传播的病毒株关系最密切。这表明这些工作人员是从他们照料的动物身上感染了SARS-CoV-2病毒。另外,很明显,许多养殖场都有不同的感染,这表明病毒已经多次从人类传播到水貂。

这是个坏消息。好消息是,它似乎没有从农场工人向普通民众传播太多。研究人员确认了34名感染者,他们来自与水貂养殖场相同的邮政编码,并对他们的病毒基因组进行了测序。在所有情况下,这些病毒看起来都像是在荷兰人群中普遍传播的病毒,而不是水貂养殖场常见的病毒。只有一名工人将水貂SARS-CoV-2毒株传播给与他们共事过的人。

(荷兰的许多水貂养殖场工人来自波兰,但在该国传播的病毒关系更远。)

这种病毒似乎在以任何特定的方式适应水貂?根据现有的序列,不是很明显。这16个农场被分成五个不同的相关病毒簇,它们似乎没有太多共同突变的方式,正如你可能认为的那样,一种病毒适应了一个新的物种。而且,在很大程度上,从水貂跳回人类体内的病毒看起来就像是水貂病毒的变种。

唯一可能表明在水貂体内感染病毒的风险增加的事情是,它似乎以比在人类体内更快的速度获得突变。但是,由于水貂养殖场的感染何时开始存在很大的不确定性,我们需要更多的数据才能有把握地说出任何事情。

因此,总体而言,这一消息多少让人安心。虽然很明显,水貂可以把我们给它们的病毒带回给我们,但它并没有导致水貂养殖场周围社区的广泛感染。很明显,研究人员是否采取了任何预防措施来限制他们感染的传播,这显然是值得一试的--研究人员收集的采访材料无疑可以解决这一问题。

另一个好消息是,该病毒似乎没有积累任何明显有助于其适应该物种的突变。这种情况显然会随着时间的推移而改变,因此我们希望继续监控这些农场。但是,在缺乏这一点的情况下,这种病毒在水貂中的存在似乎不会对人类构成戏剧性的威胁。显然,我们希望留意在丹麦或其他拥有大型水貂养殖场的国家收集的任何数据,看看这些数据是否与此相符。但是,如果是这样的话,这将是非常令人放心的。