帝国理工学院Covid型号代码发布

2020-05-02 17:50:31

这是由伦敦帝国理工学院MRC全球传染病分析中心开发的冠状病毒CovidSim微观模拟模型。

CovidSim模拟了冠状病毒感染随时间在空间结构和社会结构的人群中的传播动态和严重程度。它可以模拟干预政策和医疗保健服务如何影响冠状病毒的传播。随着参数的变化,它可以用来模拟其他呼吸道病毒,如流感。

⚠️此模型正在积极开发中,因此参数名称和行为以及输出文件格式将更改,恕不另行通知。

⚠️模型是随机的。应该用不同的种子进行多次运行,以查看平均行为。

⚠️与任何数学模型一样,很容易错误配置输入,从而得到无意义的输出。帝国理工学院冠状病毒团队只认可自己生成的输出。

在整个英国运行该模型需要大约20 GB的RAM,其他地区需要不同数量的内存(有些高达256 GB)。

强烈建议在构建模型时启用OpenMP支持,以提高多核处理器上的性能。24到32个核心至强系统可为大量(例如英国、美国)人群提供最佳性能。

重要提示:此脚本仅使用测试数据,并不反映真实情况。

Python脚本run_sample.py演示了如何调用keCovidSim来使用此数据。有关如何运行示例的详细信息,请参阅示例自述文件。

鉴于帝国理工学院的整个团队都在全职应对冠状病毒,目前的文件很少。如果时间允许,将添加更多文档和示例文件。在接下来的几周内,这将包括一组更广泛的输入文件,以对退出锁定的策略进行建模。

以下论文与该模型相关。请注意,其中一些可能需要订阅。

它是版权所有的帝国科学、技术和医学学院(Imperial College of Science,Technology and Medicine)。领衔的开发商是尼尔·弗格森、杰玛·内贾蒂-吉利亚尼和丹尼尔·雷登。

帝国科学、技术和医学学院、GitHub公司和John Carmack为开源所做的其他贡献是作者的版权。

世界流行音乐(www.worldpop.org-南安普顿大学地理与环境科学学院;路易斯维尔大学地理和地球科学系;南穆尔大学地理系)和哥伦比亚大学国际地球科学信息网中心(2018年)。全球高分辨率人口分母项目-由比尔和梅林达·盖茨基金会资助(OPP1134076)。https://dx.doi.org/10.5258/SOTON/WP00647。

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