#从头

纳米孔测序和Shasta工具包实现11个人类基因组的从头组装
Nanopore sequencing&Shasta toolkit enable de novo assembly of 11 human genomes(www.nature.com)
2020-5-6 6:21
使用纳米孔长读序列重新组装人类基因组已有报道，但它使用了150，000 中央处理器小时和数周的挂钟时间。为了实现人类基因组的快速组装，我们提出了Shasta，一个从头开始的长读汇编器，以及名为MarginPolish和Helen的抛光算法。使用单个ProMethION纳米孔测序仪和我们的工具包，我们在9 d内重新组装......