Python中的压缩感知(2016)

2022-02-25 21:35:54

在本文中,我将研究Python中的压缩感知(也称为压缩感知、压缩采样和稀疏采样)。由于压缩感知的概念可以应用于各种各样的主题,我将主要关注如何将其应用于声音和图像等一维和二维领域。具体来说,我将展示如何获取高度不完整的信号样本数据集,并重建底层的声音或图像。这是一种非常强大的技术。

你可能知道,有许多不同类型的规范。也许最常见和最广泛认可的是$L^2$norm:

$L^2$norm很好,因为它易于计算、易于区分,并且具有直观的吸引力(例如,向量的norm是其长度)。许多非常重要的算法和方法都依赖于$L^2$,包括最小二乘拟合。

也就是说,L^2$norm并不是所有东西的goto解决方案。其他规范也有许多有趣和有用的特性。考虑$^ ^ 1美元的标准:

它不求每个元素的平方,只取其绝对值。尽管绝对值令人恼火,因为它经常在其导数中引入不连续性,但与在$L^2$norm中发生的平方相比,它确实有一些独特的性质。压缩感知就是利用这些特性。

让我们用Python可视化一些数据,看看我在说什么。

#确保你';我们安装了以下软件包import numpy as np import matplotlib as mpl import matplotlib。pyplot作为plt导入scipy。优化为spopt import scipy。FFT包装为spfft导入scipy。ndimage为spimg导入cvxpy为cvx

首先我们要做的是创建一些任意的线性数据,包括一些噪声。让我们使用合成方程式:

#生成一些噪声x=np的数据。排序(np.random.uniform(0,10,15))y=3+0.2*x+0.1*np。随机的兰登(兰(x))

现在让我们在数据样本上拟合两行。对于第一行,我们将使用$L^1$norm作为良好匹配的标准;对于第二行,我们将使用$L^2$norm。

#求L1直线拟合L1_拟合=λx0,x,y:np。求和(np.abs(x0[0]*x+x0[1]-y))xopt1=spopt。fmin(func=l1_-fit,x0=[1,1],args=(x,y))#查找L2直线拟合L2_-fit=lambda x0,x,y:np。求和(np.幂(x0[0]*x+x0[1]-y,2))xopt2=spopt。fmin(func=l2_-fit,x0=[1,1],args=(x,y))

请注意,这两种拟合似乎都能很好地拟合数据。当然,它们并不完全对齐,但考虑到噪音,它们都是合理的近似值。

现在,让我们疯狂一点,添加一些异常值。换句话说,让我们扰动几个点,将它们远离直线。如果你仔细想想,这其实并不是那么不同寻常。异常值经常出现在现实世界的数据中,造成各种各样的麻烦。

#通过添加输出y2=y来调整数据。复制()y2[3]+=4 y2[13]=3#重新安装线xopt12=spopt。fmin(func=l1_-fit,x0=[1,1],args=(x,y2))xopt22=spopt。fmin(func=l2_-fit,x0=[1,1],args=(x,y2))

当我们重新绘制$L^1$和$L^2$拟合曲线时,我们看到了一些有趣的现象:$L^1$拟合曲线与数据的总体趋势保持一致,而$L^2$拟合曲线似乎被异常值“破坏”。为什么会这样?归根结底,$L^2$error得到平方,而$L^1$error没有得到平方。当你用一个$L^2$的误差解释来拟合一行数据时,异常值的位移会产生不成比例的影响,因为它们已经很大的误差正在得到平方。只要看看我们示例中两个异常值的距离,想象一下将它们平方——当然,$L^2$线发生倾斜也就不足为奇了!

然而,当使用$L^1$错误解释时,异常值的贡献不超过其位移。结果是一个更干净的适合,更符合我们的直觉,一个好的适合应该是什么样子。正是这种有趣的特性为压缩感知打开了大门。

在这个例子中(借用Kutz 1),我们将创建一个人造声波,对其进行10%的采样,并从10%的采样中重建原始信号。这是一维压缩传感。

#两个正弦波之和n=5000 t=np。linspace(0,1/8,n)y=np。sin(1394*np.pi*t)+np。sin(3266*np.pi*t)yt=spfft。dct(y,norm=';正交';)

在上面的图中,我们看到信号有一个清晰的模式,但不是微不足道的。最上面一行的曲线图是不同尺度下时域中的信号。最下面一行中的图是频谱域中的信号(即信号的频率内容)。特别是考虑到频域,我们注意到除了代表两个正弦频率的两个尖峰之外,频谱大部分为零。

现在想象一下对10%的时间信号进行采样(见下文)。你会有一个数据集,在肉眼看来,看起来像胡说八道。基本信号仍然是相同的,其频率内容也是相同的(除两个尖峰外,大部分为零)。有人可能会问,是否有可能从不完整的数据中提取这两个主频,以便我们重建信号?答案是肯定的!

#提取信号m=500的小样本#10%样本ri=np。随机的选择(n,m,replace=False)#指数ri的随机样本。排序()#排序不是严格必要的,但便于绘制t2=t[ri]y2=y[ri]

在这种情况下,由于信号的频率内容非常稀疏,压缩感知成为可能。这就是$L^1$norm发挥作用的地方。我们要做的是,在所有可能的信号中,找到与已知数据匹配的最简单的信号。换句话说,我们希望使用一个最小化例程来找到一组满足两个条件的频率:(a)基本信号与我们的数据完全匹配(或尽可能接近);(b)频率的$L^1$norm最小化。这样的例行程序将产生一个稀疏的解决方案——这正是我们想要的。

在Python中,有几种方法可以实现这一点。也许最简单的方法是利用凸优化库CVXPY。使用下面的代码最小化信号频率的范数,并限制候选信号应与我们的不完整样本完全匹配。

#创建idct矩阵运算符A=spfft。idct(np.同一性(n),常模=';正交',轴=0)A=A[ri]#进行L1优化vx=cvx。变量(n)目标=cvx。最小化(cvx.norm(vx,1))约束=[A*vx==y2]prob=cvx。问题(目标、约束)结果=问题。求解(verbose=True)

你可能会问:那该死的$A$matrix是什么?这是整个派对的关键。让我解释一下。

为了实现极小化,我们必须以某种方式将问题转化为线性方程组:

具体来说,我们想要导出一个矩阵$a$,它可以与一个候选解决方案$x$相乘,得到$b$,一个包含数据样本的向量。在我们当前问题的上下文中,候选解决方案$x$存在于频域中,而已知数据$b$存在于时域中。显然,矩阵$A$执行采样和从光谱到时间域的转换。

压缩感知实际上可以归结为能够正确推导$A$运算符。幸运的是,有一种方法。首先,让$f$作为矢量形式的目标信号(如果信号是二维或更高的,则将其展平),并将$\phi$作为采样矩阵。然后:

现在,让$\psi$成为将信号从光谱域转换到时域的矩阵。考虑到频域中$x$的解决方案,它如下所示:

所以,$A$只是由从域变换矩阵$\psi$中采样的行组成。$\psi$矩阵易于构造——它是作用于单位矩阵列的逆离散余弦变换。矩阵积$\psi x$相当于执行idct(x)。

现在我们已经构建了$A$矩阵并运行了最小化,我们可以通过将解从频域转换到时域来重建信号。下面左侧是原始信号及其频率内容。右边是我们的$L^1$近似值。我想说,只使用10%的数据是非常好的!

一个突出的问题是,重建质量在$t=0$左右明显下降。这可能是因为我们的采样间隔违反了余弦变换的周期边界条件要求。当然,给定一个任意的信号样本,事先不知道其性质,很难不违反周期性边界条件。好消息是,现在我们对真实信号的频率有了一些非常清晰的指示。如果需要,我们可以返回并在满足周期边界的间隔内重新采样信号。

现在,让我们使用我们从一维案例中学到的知识,在二维中进行压缩感知。这才是真正有趣的开始,因为我们现在可以尝试重建图像。

下面,我们将使用与之前完全相同的方法对M.C.Escher的图像瀑布进行随机采样和重建(约1200×1600像素)。由于$A$矩阵带来的内存限制,我们将首先考虑缩小版本的图像(约50×65像素)。在接下来的部分中,我们将扩展例程以处理大型图像。

请注意,SciPy不提供dct或idct的2D版本。然而,通过认识到2D离散余弦变换只不过是作用于$x$行的dct,然后是作用于其列的第二个dct(反之亦然),可以很容易地构造它们:

作为个人偏好,我喜欢告诉SciPy的dct和idct方法对矩阵的列进行操作(而不是对行进行操作的默认行为)。首先,这使Python代码与MATLAB代码保持一致。其次,它使构建矩阵运算符更直观(至少对我来说)。例如,如果我们让$Y$是一个$m$乘$n$矩阵,其中$I_m$和$I_n$分别是大小为$m$和$n$的单位矩阵,那么

这两个版本都可以使用,但我觉得第一个版本更干净,因为它自然地将矩阵运算符放在操作数前面。每当我提到dct或idct时,假设我指的是轴=0。

def dct2(x):返回spfft。dct(spfft.dct(x.T,范数=';正交';,轴=0)。T,norm=';正交',轴=0)def idct2(x):返回spfft。idct(spfft.idct(x.T,norm=';正交';,轴=0)。T,norm=';正交',axis=0)#读取原始图像并缩小尺寸以获得速度xOrg=spimg。imread(';escher#u瀑布.jpeg';,flatte=True,mode=';L';)#读取灰度X=spimg。缩放(Xorig,0.04)ny,nx=X。形状

与上一节一样,我们将随机抽取图像索引样本,形成我们的$b$矩阵。然后,我们将生成$A$矩阵。

为2D图像数据创建$A$矩阵需要比在1D情况下更巧妙的技巧。在接下来的推导中,我们将使用Kronecker乘积$\otimes$和2D离散余弦变换是可分离的这一事实来生成运算符$A$。

假设$X$是光谱域中的图像,$D_i=\textit{idct}(i_i)$,其中$i_i$是大小为$i$的单位矩阵。然后:

如果$\textit{vec}(X)$是将$X$的列堆叠在彼此之上的向量运算符,则:

显然,Kronecker产品是我们想要的转换矩阵$\psi$。因此,我们的矩阵$A$变成了$A=\phi(D_n\otimes D_m)$,其中$\phi$是采样矩阵。你可以用Numpy计算Kronecker积。克朗。这种方法的主要问题是Kronecker产品可以很快变得非常巨大。如果你的目标图像是$m$乘$n$,并且你要采集$k$样本,那么$A$矩阵的大小为$(mnk)^2$。这就是说,对于小图像来说,这是很好的。

#提取信号k=round(nx*ny*0.5)#50%样本ri=np的小样本。随机的选择(nx*ny,k,replace=False)#指数b=X的随机样本。T平坦[ri]b=np。展开_dims(b,轴=1)#使用kron(大ny*nx的内存错误)A=np创建dct矩阵运算符。kron(spfft.idct)(np.identity(nx),norm=';正交',轴=0),spfft。idct(np.身份(ny),常模=';正交',轴=0)A=A[ri,:]#与φ乘以kron相同#进行L1优化vx=cvx。变量(nx*ny)目标=cvx。最小化(cvx.norm(vx,1))约束=[A*vx==b]prob=cvx。问题(目标、约束)结果=问题。求解(verbose=True)Xat2=np。数组(vx.value)。挤压()

#重建信号Xat=Xat2。重塑(nx,ny)。T#堆栈列Xa=idct2(Xat)#如果不是np,则确认解决方案。allclose(X.T.flat[ri],Xa.T.flat[ri]):打印(';警告:样本索引处的值与原始值不匹配。';)创建蒙版图像(用于可视化)蒙版=np。零(X形状)遮罩。T平坦[ri]=255 Xm=255*np。一个(X.形状)Xm。T平坦[ri]=X。T平[里]

好吧,结果不太好。最左边的原始图像几乎无法理解。分辨率很低,所以我们必须取50%的大ish样本(布尔掩码显示在左中;掩码图像显示在右中)。不管怎样,这一过程显然奏效了:最右边的重建图像肯定与原始图像很接近,尽管效果很差。

考虑到我们正在进行的概念验证,有很多方法可以改进。基于Kronecker的方法虽然易于实现,但对于大型图像来说是不可用的。还有什么其他方法?

使用CVXPY的凸优化不一定是找到$L^1$最小值的唯一方法。通过一点在线研究,我找到了L-BFGS算法6及其变体OWL-QN3。我们对OWL-QN算法特别感兴趣,因为它允许通过最小化以下形式的函数来拟合$L^1$正则化模型:

其中,$f$是可微凸损失函数,$C$是常数。在我们的例子中,我们可以将$f$定义为最小二乘目标函数,它只是剩余平方的$L^2$范数:

现在剩下的就是编码了!在尝试了几个不同的选项后,我最终决定使用libLBFGS(用C编写)来实现OWL-QN。为了从Python中访问它,我使用Python和Numpy的C API对其进行了包装。你可以在PyLBFGS找到我的实现。有关安装说明和基本用法,请参阅项目自述。如果你遇到虫子,请告诉我。

libLBFGS(扩展为PyLBFGS)的好处在于,您可以随意定义目标函数。换句话说,我们不必盲目遵循$Ax=b$模型。重要的是我们能够计算剩余平方的范数及其梯度。我们根本不需要生成$A$!

下面的代码比用文字更好地解释了我的意思。请特别注意传递给OWL-QN算法的evaluate回调。

从pylbfgs导入owlqn def评估(x,g,步骤):&34""内存中的求值回调""" # 我们想要返回两件事:#(1)残差的范数平方,和((Ax-b)^2) 和#(2)梯度2*A和#39;(Ax-b)#首先展开x列x2=x。重塑((nx,ny))。T#Ax只是x2 Ax2=idct2(x2)#堆栈列和提取样本Ax=Ax2的逆2D dct。T平坦[ri]。重塑(b.形状)#计算剩余的Ax-b及其2-范数平方Axb=Ax-bfx=np。求和(np.power(Axb,2))#将剩余向量(kx1)投影到空白图像(ny x nx)上Axb2=np。零(x2.形状)Axb2。T扁平[ri]=Axb#先填充列#A和#39;(Ax-b)只是Axb2 AtAxb2=2*dct2(Axb2)AtAxb=AtAxb2的2D dct。T重塑(x.shape)#堆叠列#复制渐变向量np。copyto(g,AtAxb)返回fx#缩放图像的分数,以随机采样,采样大小=(0.1,0.01)#读取原始图像Xorig=spimg。imread(';escher#u瀑布.jpeg';)ny,nx,nchan=xOrg。形状#对于每个样本大小Z=[np.zero(Xorig.shape,dtype=';uint8';)对于样本大小为[u]的s,掩码=[np.zero(Xorig.shape,dtype=';uint8';)对于样本大小中的s]对于i,枚举中的s(样本大小):#创建随机抽样索引向量k=round(nx*ny*s)ri=np。随机的选择(nx*ny,k,replace=False)#索引的随机样本#范围内j的每个颜色通道(nchan):#提取通道X=Xorig[:,:,j]。挤压()#创建遮罩图像(用于可视化)Xm=255*np。一个(X.形状)Xm。T平坦[ri]=X。T平面[ri]掩模[i][:,:,j]=Xm#对图像进行随机采样,将其存储在向量b=X中。T平坦[ri]。astype(float)#在内存Xat2=owlqn(nx*ny,evaluate,None,5)中执行L1最小化#将输出转换回空间域Xat=Xat2。重塑(nx,ny)。T#stack columns Xa=idct2(Xat)Z[i][:,:,j]=Xa。aType(';uint8';)

OWL-QN的快速C实现允许我们处理整个瀑布图像的样本,而无需任何缩放。我们现在可以处理图像的三个颜色通道中的每一个,而不是像以前那样在灰度中进行所有操作。上面显示的解决方案真正展示了压缩感知的威力。原始的全彩图像显示在左侧。中间的图像是随机的10%样本。解决方案图像位于右侧。虽然该解决方案包含一些明显的瑕疵,由于不良的颜色通道混合,整体精度是不可思议的。此外,只要格外小心和注意,这些瑕疵可能会被去除——要么通过后处理(例如高斯滤波器),要么通过考虑颜色通道的改进压缩感知实现。一种可能性是尝试预先确定可能的调色板,然后将其纳入压缩感知例程。

我还包括了一张根据1%的可用数据重建的图像,这只是为了好玩和咯咯笑。它肯定是模糊的,但仍然可以辨认!

数据驱动的建模和科学计算:整合复杂系统动力学和大数据的方法(2013).  ↩

坎德、伊曼纽尔·J.和迈克尔·B·沃金。“压缩采样简介。”信号处理杂志,IEEE 25.2(2008):21-30。  ↩

安德鲁、盖伦和高剑锋。“L1正则对数线性模型的可扩展训练。”第24届国际机器学习会议记录。ACM,2007年。  ↩

维基百科撰稿人。“压缩感知。”维基百科,免费的百科全书。维基百科,免费百科全书,2016年3月26日。网状物5月26日。2016.  ↩

维基百科撰稿人。“克罗内克产品。”维基百科,免费的百科全书。维基百科,免费百科全书,1

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