我们对关闭英国的新SARS毒株的了解

2020-12-22 05:19:42

大流行冠状病毒的一种变体SARS-CoV-2现在占据着头条新闻,并且在世界范围内激发了预防性旅行禁令。但是科学家们仍在设法掌握该变种的实际作用,以及对将近一年的大流行可能意味着什么。

英国的研究人员(已识别出该变体并正在迅速传播)建议其传播率可能比其他SARS-CoV-2株高70%,这让人担心在一年前夕疾病激增时可能会激增。假期结束。但是其他研究人员现在正在迅速收集有关变体与人细胞相互作用和免疫反应的数据,以查看这些相互作用是否不同于其他SARS-CoV-2株所见。

尽管对于被称为B.1.1.7的变体尚有许多未知的地方,但仍有一些令人放心的方面。一方面,病毒积累微小的基因变化是正常现象,例如那些产生了新的UK变体的基因变化(更多内容请参见下文)。在整个大流行中还发现了许多其他变体,没有任何变体引起任何噩梦。

到目前为止,没有理由认为新事物会发生很大变化。到目前为止,尚无证据表明B.1.1.7会导致其他或更严重的COVID-19疾病;似乎也不会降低COVID-19的治疗效果。英国官员还怀疑,新批准的疫苗在对抗新变种方面也能发挥同样的作用,尽管研究人员正在努力确认这一点。

综上所述,现有信息表明B.1.1.7应对流行病的推荐策略变化不大,无论哪种变异正在人群中蔓延。 "最重要的是,我们需要尽快抑制所有SARS-CoV-2病毒的传播,"世界卫生组织总干事特德罗斯·阿达诺姆·格布雷耶苏斯周一在新闻发布会上说。

透视透射率的增加也很重要。而高达70%的"这个数字确实确实令人震惊,传输速率的实际增加幅度不大。根据WHO的COVID-19大流行技术负责人Maria Van Kerkhove的说法,在英国,B.1.1.7的存在使病毒的繁殖数量仅从1.1升至1.5,仅增加了0.4。 。这一小幅增长意味着每个感染者继续感染的人数从平均超过1人增加到1.5人。目前尚不清楚这种增加是否是由于病毒固有的原因,感染者的行为或两者的结合。

世卫组织紧急情况计划执行主任迈克·瑞安(Mike Ryan)博士指出,上升0.4并不是一个好消息,但这也不是一件坏事。他指出,可以控制1.5的繁殖数量,在这种大流行期间,病毒的繁殖数量在其他几次上都更高。

" [这]只是稍微提高了一点,"瑞安说。我们不是在谈论像麻疹这样的生殖数字,它在12到18之间,或者腮腺炎和水痘在10到12之间。我们在谈论1.5。该病毒的传播效率可能有所提高,而当我们感染了如此多的人时,这可能会对数字产生很大影响。但这意味着可以包含病毒,可以使用完全相同的干预措施,完全相同的行为来抑制病毒。像之前一样。

Van Kerkhove强调了最后一点,阐述了没有理由认为传播的轻微障碍是因为病毒改变了它从一个人传播到另一个人的方式,例如在空气中传播得更远或在人体内传播更容易。表面。它是一种呼吸道病原体,因此它通过空气中的这些微粒在我和您之间传播,范·科霍夫(Van Kerkhove)解释说。 "主要发生的是该病毒在彼此密切接触的人之间传播。还是一样。

尽管WHO强调B.1.1.7与其他SARS-CoV-2株之间的相似性,但英国政府一直在关注新特性。这是首次发现该菌株的地方,大多数感染该菌株的人都在英国。

由于在英国正在进行的监视工作,有关该新病毒株的详细信息变得显而易见,研究人员每月在英国对数十个病毒样品的基因组进行随机测序。在大流行过程中,SARS-CoV-2流行株通常每个月平均拾起一两个突变,因此这种监视水平足以跟踪新株的起源和传播。但是B.1.1.7首先出现在9月下旬获得的样本中,却没有像我们以前看到的那样逐渐积累变化。它与最密切相关的已知菌株之间存在17个差异,从而使B.1.1.7在冠状病毒家族树上自行摆脱了分支。

该"自己"是好奇心,而不是关注点。引起人们注意的是一种相关性。为了应对整个欧洲的冬季感染浪潮,英国重新启动了一系列旨在降低感染水平的社会限制措施。而且,在该国大部分地区,这些限制正在按预期进行。但不在英国的东南和东部。恰恰是B.1.1.7菌株水平最高的区域。到12月中旬,在一个县中,B.1.1.7占所有新感染病例的20%以上,并且此数字一直在上升。

这不是B.1.1.7菌株具有任何优势的决定性证据。 COVID-19大流行的特征是许多" superspreader"亵渎公共卫生措施的事件和社会团体。这种组合可能导致恰好在这些时刻在这些组中循环的菌株迅速扩增。但是,到本周末为止,B.1.1.7占伦敦新病例的约60%,导致那里的政府官员声称这种病毒可以更快地传播。

但是,要确定这一点,我们必须将B.1.1.7中发现的突变工程化为实验室菌株,然后测试其感染性。同时,科学家们研究了新病毒株中存在的突变,并推测哪些突变可能会使其具有增强的传染性或改变感染的过程。

虽然B.1.1.7代表了一种冠状病毒的新菌株,但我们对冠状病毒的生物学知识相当了解,这使我们能够确定何时突变改变了关键区域。并且,在某些情况下,已经在我们先前表征的不同菌株中单独发现了突变。因此,可以推断出有关B.1.1.7行为的一些信息。

它们中的几种发生在冠状病毒表面的棘突蛋白中,这有助于它们锁定在细胞表面的蛋白上。 B.1.1.7中发现的一种突变特异性地改变了参与该过程的峰的一部分,并且发现该突变会增加病毒蛋白与人蛋白之间的亲和力。另一个突变从刺突蛋白中删除了两个氨基酸。这与降低的免疫反应有关,但通常仅与其他突变结合使用(如此处所示)。

最后,另一个突变是在穗蛋白被切成两个较小片段的位点旁边,这是其功能所必需的。虽然尚未对突变进行鉴定,但其位置具有提示意义。

B.1.1.7中发现的另一个突变完全消除了一种病毒蛋白(称为ORF8)。今年早些时候在新加坡发现了另一种破坏该基因的突变,在受感染者中似乎没有那么严重的症状。但是,由于新加坡已成功控制了这一大流行,因此该菌株已不再受到任何主动感染,因此我们在那儿没有进一步的数据。

还可以从B.1.1.7整体上发现的突变集合中收集一些提示性信息。在表征它的17种突变中,有14种改变了病毒编码的蛋白质。只有三个没有变化。这是一个非常高的百分比,通常表示某些变化的进化选择。

在感染后免疫功能低下的个体中,以前也已经发现在相对较短的时间内产生B.1.1.7所必需的高突变率。在这些个体中,感染可能需要一个月以上的时间才能解决,并且经常给他们直接针对病毒的治疗方法,例如恢复性血浆和瑞昔韦韦。因此,这里看到的至少某些变化可能是由于这些处理所施加的选择性进化压力所致。 (此分析背后的研究人员指出,这是一个假设,而不是我们得出的任何结论。)

尽管所有这些差异都是暗示性的,但必须强调的是,我们没有确切的证据表明它们中的任何一种都会改变病毒的行为。因此,尽管其传播的数据是戏剧性的,但我们甚至仍不确定这些突变的产物,它们对病毒感染过程的影响很大程度上取决于猜测。当我们等待生物学家们掌握B.1.1.7中的变化时,WHO的建议仍然很简单:一定要采取公共卫生专家几个月来一直建议的措施。