辉瑞生物科技疫苗可能比你想象的有效得多

2020-11-12 03:24:23

疫苗有效性的点估计值可能为97%,远高于90%。

昨天有消息称,辉瑞公司和BioNTech公司联合开发的SARS-CoV-2候选疫苗在中期分析中被确定为有效。这是个极好的消息。或许是今年最好的消息。然而,这是通过新闻稿展示科学的又一个例子。新闻稿中包含的信息非常有限,人们只能奇怪为什么他们不能花时间为科学界写一份两页的报告。

这就是说,我们可以从发布中得出一些推论,这可能有助于理解这一点。从新闻稿中我们了解到,共有94名新冠肺炎案件被记录在案。

在这些讨论结束后,可评估的病例数达到94例,DMC对所有病例进行了第一次分析。";

然而,我们不知道其中有多少来自对照组,有多少来自治疗组。我们也不知道总共有多少受试者在治疗和控制武器中。我们确实得到了两条关于疗效的重要引述。

在第一次中期疗效分析中发现,候选疫苗在无SARS-CoV-2感染证据的参与者中预防新冠肺炎的有效性超过90%。

接种疫苗的个人和接受安慰剂的人之间的病例分裂表明,在第二次接种后7天,疫苗有效率超过90%。

我们应该如何解读这些呢?观察组的感染率是否降低了90%,或者我们如何推断真正的(人口参数)疗效至少为90%?我会争辩说,措辞支持后者。如果他们只是提供一个点数估计,为什么要把它表示为一个界限呢?如果疫苗实际有效率有合理的概率低于90%,他们为什么要把它表述为疫苗有效率高于90%?

通过查看研究设计,我们可以获得一些额外的见解。它规定了如何进行中期分析。具体来说,在第102-103页,它要求使用带有弱信息先验的Beta二项式模型进行贝叶斯分析。

对我来说,最符合他们新闻稿的统计翻译是,我们以95%的概率确定疫苗的效力大于90%。为什么是95%的概率?嗯,如果你在做贝叶斯分析(处理它),95%的概率区间是医学文献的标准区间,设计文档中散落着每条尾巴都有2.5%概率的95%的区间。他们将把这些指控提交给FDA,因此他们很可能会坚持标准的证据规则。

假设我的解释是正确的,让我们回到治疗组中有多少病例。根据感染总数,治疗组感染人数呈二项分布。我们在此后验结果之前应用贝塔系数,然后将我们的推论从二项式比例转换为疫苗效力。疫苗的有效性是两组之间的感染率比减去1,而感染率比与二项式比例有关,作为赔率。

>;#参考:https://pfe-pfizercom-d8-prod.s3.amazonaws.com/2020-09/C4591001_Clinical_Protocol.pdf >; >;#上一个间隔(与第103页上的前一个间隔匹配) >;Qbeta(c(.025,.975),.700102,1) [1]0.005148448 0.964483043 >; >; >;#后部 >;Cases_Treatment<;-3 >;Cases_Control<;-94-Cases_Treatment >;theta_ci<;-Qbeta(c(.025,.975),Cases_Treatment+.700102,Cases_Control+1) >;rate_rate_ci<;-theta_ci/(1-theta_ci) >; >;#有效性 >;100*(1-Rate_Ratio_Ci) [1]98.98688 90.68447 >;库(Ggplot2) >;xx<;-(0:60)/500 >;yy<;-sApply(xx,函数(X)dbeta(x,Cases_Treatment+.700102,Cases_Control+1)) >;xx<;-100*(1-xx/(1-xx)) >;gglot()+ +geom_area(aes(x=xx,y=yy))+ +Theme_BW()+ +xlab(";疫苗有效性)+ +Ylab(";后部密度";)。

治疗下限大于90%的最大病例数为3例,相当于对照组91例。因此,疫苗的估计有效性为97%,概率区间为90.7%至99.0%。因此,可以肯定的是,有效率可能在90%左右,但可能性要高得多,如下面的后图所示。

要正确看待这一点,请考虑97%有效疫苗未能提供保护并导致感染的比率。90%有效疫苗的失败率是97%有效疫苗的3.3倍,所以如果你给一个人群接种了90%有效疫苗,而每个人都接触了疫苗,那么你预计感染人数将是使用97%有效疫苗的人群的3.3倍。

我确实注意到,分析计划要求使用顺序停止规则来保留第I类错误;然而,我不认为任何报告的统计数据会因此而进行调整。与频率区间不同,贝叶斯区间是不变的,无论你做多少中期分析。

我们还有很多不知道的东西,希望在接下来的几周里我们会有更多的科学发现。目前看来,这种疫苗的效果似乎远远超出了我的基线预期,甚至可能在97%或更高的范围内。

我对新闻稿的理解可能是错误的,事实上,他们谈论的是样本效力,而不是真正的效力。在这种情况下,94例中有8例在治疗组中,真正有效的间隔在81.6%到95.6%之间。后验分布看起来相当不错,但没有前一次那么好。

不过,重要的是要有现实的期望。在决定疫苗的有效性方面,效力并不是唯一重要的衡量标准。由于研究人群只被跟踪了几个月,我们不知道疫苗能提供多长时间的保护。有重要证据表明新冠肺炎会再次感染,因此人们预计疫苗不会提供永久免疫力。如果豁免期很短(例如3个月),那么它不会是我们正在寻找的灵丹妙药。如果能持续两年,我会很高兴看到这一年的豁免权和欣喜若狂。

此外,还有副作用。我们将不得不看看这项试验的结果,但在第二阶段试验中,大约8%或17%的受试者(我不确定第三阶段的剂量)在加强免疫后出现发烧。很可能你会想在第二次工作结束后休息一天,以防你感觉不舒服。副作用的发生率可能会损害疫苗的接种率。